تدعم الفهارس Indexing الحل الفعال للاستعلامات. بدون فهارس، يجب على MongoDB فحص كل مستند في المجموعة لتحديد تلك المستندات التي تطابق بيان الاستعلام. هذا الفحص غير فعال إلى حد كبير ويتطلب من MongoDB معالجة كمية كبيرة من البيانات.